作为这支蔡州南征军的主帅，秦宗衡在大军之中的威望和号召力远不及孙儒，更何况军中大半将领还是孙儒的手下，如果秦宗衡想要抛开孙儒一意孤行，估计大半将士不会理睬他。所以，秦宗衡必须搞定孙儒，必须让孙儒听从指挥调遣。
于是，秦示衡便屡次对孙儒指手画脚、大呼小叫，要求孙儒就是爬也爬着去救援蔡州。看到秦宗衡那张愤怒而又丑陋的脸，孙儒内心极其厌恶痛恨。看来，要想摆脱秦宗权的控制、要想彻底控制这支蔡州南征军，必须提前对秦宗衡下手了。
在又一次被秦宗衡训斥痛骂后，孙儒似乎有些头脑开窍、思想清醒了，决定听从秦宗衡的调遣安排，带病率兵救援蔡州城。孙儒提议，大家南征已经好几个月了，也没有好好的休息庆祝下，建议应该大摆宴席犒劳下众将士们，然后再率兵北返，救援蔡州。
于是，蔡州南征军内部举行了一场庆祝酒宴，大家欢声笑语、把酒言欢，十分高兴。但孙儒的几位心腹爱将刘建峰、马殷等人却在孙儒那张充满微笑的脸上，发现了不易察觉的一丝杀机，这种杀机隐藏的很深，一般人极难察觉。
正当大家酒酣耳热之时，孙儒拿著酒杯来到了同样喝的兴奋头晕的秦宗衡面前，向秦宗衡陪酒道歉：“主帅大人，以前多有冒犯之处，请多多谅解。以后大家应该精诚团结，共同对敌。”
当大家看到，秦宗衡浑身是血的倒在血泊中，旁边站立着满脸凶神恶煞、手持利刃的孙儒，这幅血腥的场景时，大家似乎才恍然明白。在场的很多将领，诸如刘建峰、马殷、张佶等，都是孙儒的心腹将领，对于孙儒干掉秦宗衡，自然不会持什么反对意见。
少数秦宗衡的亲信，看到孙儒那张狰狞可怕的表情，即使心中有所想法，也不敢吭声，选择了沉默。即便是秦宗衡的族弟秦彦晖，似乎也没有主动出头，为秦宗衡报仇。蔡州南征军的大多数的将领都选择了拥护孙儒，孙儒理所当然的成为这支蔡州南征军的最高统帅。
当然，也有不愿听从孙儒指挥的哥们，军中的沙陀族将领安仁义选择了离开孙儒，直接投降了杨行密。安仁义的离开对于孙儒来说，确实有些损失，毕竟安仁义是蔡州大军中的一员猛将。
蔡州是不会再去了，淮南这块地盘，经济富庶、土地肥沃，又远离战火连篇的中原，绝对是称雄割据的理想区域，就凭这数万蔡州的精兵强将，孙儒有决心称霸淮南。孙儒派人把秦宗衡的脑袋送给宣武节度使朱温。
本着敌人的敌人就是朋友的原则，既然已经和秦宗权彻底闹翻了，那么就必须寻找合适的结盟对象，朱温是秦宗权最大的对手，孙儒讨好朱温，绝对有利于他将来抗衡秦宗权。
孙儒和手下的将领刘建峰、马殷、张佶、秦彦晖等共同盟誓，大家统一思想、统一目标，经过优胜劣汰、精挑细选，最后聚拢了一万多精兵强将，并改名为“土团白条军”，大致意思是本土本地的大军。
于是，孙儒率领土团白条军以及毕师铎、秦彦两位降将，开始了他称霸淮南的第一站，高邮县。
之所以不对淮南节度使治所扬州下手，孙儒已经发现扬州其实只不过是座残缺不堪的破城，整个扬州城附近粮草早已被耗尽，为了先让数万大军填饱肚子，孙儒决定向扬州以北的高邮等州县下手。
高邮只不过是个县城，根本抵挡不住蔡州大军的进攻，很快失守。占据了高邮的孙儒继续四处攻略各处州县，模仿秦宗权的做风，到处肆虐平民百姓，但就是迟迟不对扬州城下手。
在对扬州下手之前，孙儒决定先做一件事，铲除内患、稳定军心。毕师铎和秦彦虽然投靠了“土团白条军”，但很显然，孙儒对于这两位昔日黄巢的部将很不放心，暗中一直在吞并拉拢毕师铎、秦彦的残部。
毕师铎和秦彦逃离扬州时，身边还有二千多人的部队，但逐渐被孙儒所吞噬，毕师铎手下的裨将唐宏一看形势不妙，为了自保，便主动向孙儒告发毕师铎和秦彦打算联合朱温的大军叛乱。既然有人告发，孙儒自然不会轻易放过毕师铎和秦彦。
文德元年即公元八八八年正月，孙儒下令将毕师铎和秦彦处斩，罪名是勾结朱温叛乱，然后顺利成章地吞并了毕师铎和秦彦的部队。解决了内患，孙儒终于开始将目光指向了扬州城。杨行密虽然占据了扬州城，但随着蔡州军团的到来，整个淮南的军事力量发生了重大改变。
即使蔡州南征军内部发生了兵变，也丝毫没有影响蔡州大军的战斗力，孙儒是个比秦宗衡更为可怕的凶狠对手，杨行密一方面积极和朱温联络，打算依靠朱温的力量来牵制孙儒，另一方面，杨行密听从了手下幕僚谋士袁袭的建议，打算放弃残破不堪的扬州城，暂时躲避下锋芒正盛的孙儒土团白条军。
但此时的朱温正忙着对付秦宗权，而且和孙儒之间似乎并没有太多的矛盾冲突，除了推荐杨行密为淮南节度使留后之外，朱温暂时帮不上杨行密。孙儒野心勃勃、嗜好杀戮。在扬州之战中和秦彦、毕师铎苦战了半年的杨行密处境变得岌岌可危，几次交锋过后，孙儒率领的土团白条军攻陷扬州城，杨行密被迫退出扬州，回到庐州。
自从退出扬州城之后，杨行密短时期内不再去招惹孙儒的土团白条大军，而是改为攻打宣州，准备将势力扩张到浙西一带。正当杨行密千辛万苦攻下宣州之际，老家庐州却被孙儒给包抄了。
龙纪元年六月，孙儒对杨行密的老家庐州发动攻击，杨行密任命的庐州刺史蔡俦献城投降，孙儒轻松占据庐州。杨行密决定将进军的目标转向浙西苏、常、润一带。
淮南的乱局虽然还没波及到江南，但在钱镠看来，孙儒和杨行密早晚会成为自己的强劲对手，所以必须先占稳江南苏、常、润三州，然后再对付这两位对手。
这年三月，远在长安皇宫的唐朝朝廷终于发生了件大事，皇帝李儇因病去世了，享年才二十七岁，继位的是李儇的弟弟李晔。如今的皇帝已经无法控制天下的乱局，孙儒和杨行密随时都有可能侵吞江南、浙西，钱镠不行动，那就只等着别人来搬脑袋了。
占据了扬州城的孙儒自称淮南节度使，成功的取代杨行密，成为淮南乃至江南一带的头号军阀。为了能够顺利地消灭淮南一带以杨行密为主的其它力量，孙儒决定稳固后方，先安抚摆平淮北、河南一带的藩镇集团，比如宣武节度使朱温，朱温的地盘正好在淮南的北方，如果不把朱温安抚好，孙儒称霸淮南的计划就无法顺利实现。
对于朱温，孙儒一开始就表现出了友好的态度，先后把秦宗衡、毕师铎、秦彦的脑袋送给朱温，又主动送款于朱温，因此博得了朱温的好感，朱温甚至还举荐孙儒为检校司空、招讨副使。