自来也看着身后木叶村子，微微的一笑，这个村子承载着自己的快乐与忧伤，如果没有这个村子，或许自己永远都不会有今天的自己，对于蛤蟆老大的预言，自来也虽然没有明白究竟是什么，
但是从现在看来，这个人不是自己的爱徒波风水门，也不是长门，想到波风水门自来也也是非常的心痛，这个孩子可是自己最看好的一个接班人，也是成功的当上了木叶村的火影，本来自来也觉得自己的人物已经是完成了，但是现在情况来看完全的不是这样，其实对于波风水门的实力，真的算得上是一代非常厉害的火影了，波风水门的实力有着别人无法比拟的资本，如果说是鸣人有挂，波风水门挂还真的不多，
自己的媳妇都是自己一步步的争取过来的，水门自童年时代便立志当上火影。漩涡玖辛奈原本不太看好他，认为他过于阴柔。但在她被云忍掳走时，水门是唯一一位注意到玖辛奈利用红头发留下追踪线索的人，并从三位云忍手中救了她，并夸赞她的红头发很漂亮，完美地上演了一出"英雄救美"。玖辛奈对他的态度从此改变，并爱上了他，也爱上了她自己的红发。
第三次忍界大战中，水门遇到了当时自认为是最强组合的AB组水门VSAB组合合——云忍村第三代雷影之子、即将继任第四代雷影的艾，以及其义弟、八尾人柱力奇拉比。水门与两人展开激烈交战，在战斗中水门对奇拉比的实力大加赞赏，并且看穿了比所拥有的"珍贵之物"，以此对艾进行开导，但艾并没有理解水门所说之话的含义，战斗以双方平手结束。
此后，木叶因前所未有的战力缺失，所以令当时还是上忍的波风水门以及旗木卡卡西、野原琳、宇智波带土去炸毁敌方补给要道——神无毗桥。当时12岁的卡卡西当日晋升上忍，水门将带有飞雷神标记的苦无送给卡卡西。身为上忍的卡卡西带领琳和带土自成一队，在遭遇敌人之时率先发动攻击，但因为没意识到"千鸟"
的缺陷而陷入危机，此时水门以飞雷神之术迅速斩杀敌军的上忍，在救下卡卡西之后前往正面战场。后卡卡西遇险，水门以苦无上的标记救下卡卡西，并得知了带土的死讯。之后，与卡卡西和琳一起摧毁了神无毗桥并且结束了第三次忍界大战，从此名扬忍界。
第三次忍界大战结束后，在木叶做出让步的前提下，木叶与岩忍者成为火影村签订了和约。为了对在战争中牺牲的木叶忍者负责，同时迫于木叶高层的压力，第三代火影主动辞去了火影之位。凭借在第三次忍界大战**色的表现，在征得火之国大名的一致同意之后，水门顺利成为了火之国木叶忍者村的第四代火影。
在鸣人出生当天，水门喜极而泣，但就在此时戴着面具水门之死的神秘男子突然现身并挟持了鸣人。面具男的目的是控制玖辛奈体内的九尾袭击木叶，虽然水门救下了鸣人，但却没能阻止面具男召唤九尾，于是水门在安置好鸣人和玖辛奈之后便前去迎战面具男，在交战过程中惊讶于面具男的能力，
怀疑他可能是当年与初代火影交战过的宇智波斑。水门认为面具男是个危险的人物，在经过几个回合的交手后以飞雷神第二段打败面具男，面具男受伤逃走。此时九尾已开始袭击木叶，水门以飞雷神之术将自己和九尾带离木叶村，将九尾的阴属性查克拉以尸鬼封尽和自己一同封印，阳属性查克拉则以八卦封印封印到刚出生的鸣人体内。在对鸣人留下最后的话语后，水门和玖辛奈便双双去世。
佩恩之战的时候，鸣人即将撕下封印，四代火影出现在鸣人修复封印的意识空间，鸣人向四代诉说这些年的辛酸，而四代只能对鸣人怀着歉意："想以父亲的身份道歉也不够资格吧。"此后，四代火影将其让鸣人成为九尾人柱力的原因以及十六年前面具男的真相告诉了鸣人，并解除了鸣人心中的疑惑，修补封印后，因查克拉用尽而消失。
在第四次忍界大战期间，佐助为了知晓一切的真相而令大蛇丸复活，并要水门转生求大蛇丸带他见"知晓一切的人"。大蛇丸利用"尸鬼封尽·解"使四位火影以秽土转生的方式复活，佐助自初代火影那里得到了他想要的答案，和四位火影一同奔赴战场。
在最后的战场，水门终于与儿子鸣人再会，并且发现了面具男就是带土的事实。带土在那之后便成为十尾人柱力，水门面对这样的带土而陷入苦战，右手还因为带土的求道玉和阴阳遁无法修复，便和鸣人联手与带土对抗。之后鸣人在尾兽拔河中胜了带土，带土因而失去六道仙人的力量。
卡卡西打算亲手了结带土，水门见状上前加以制止，并指出卡卡西没有及时从内心深处救赎带土的错误。而带土随即遭到黑绝附身，与水门、卡卡西对峙；此时我爱罗和小樱将因九尾被抽离而濒死的鸣人送到水门之处，水门为了拯救鸣人的性命打算将自身的九尾阴查克拉传输给鸣人，却遭到黑绝的阻挠，九尾也被黑绝，也就是被附身的带土夺取。随后赶到的斑打算劝诱带土重返自己一方，
水门为阻止斑而进入仙人模式发动攻击，但却反而被斑切断左臂。失去双臂的水门难以再战，不过仍然在一旁支援卡卡西以及随后赶来的凯的战斗，并在阿凯以八门遁甲之阵与斑进行殊死搏斗之时与在场众人制定战术进行援护，更以飞雷神之术舍身替阿凯转移斑的阴阳遁术攻击，以使阿凯的攻击奏效。
飞雷神之术此术式为第二代火影所开创的时空间忍术，利用术式达到瞬间移动和空间跳跃，水门以此为基础进行改进，术的构造非常神秘。此术能达到超越瞬身的神速，让人自由穿越时间、空间，并在各战场间任意穿梭，这亦是使他拥有"黄色闪光"称号的典故。使用时需要留下显示目标坐标的术式，使用者会在自己身体所能碰触到的地方留下术式，
当敌人的身体被留下术式时，就意味着被书写上了代表死亡的咒印。绝大多数情况下飞雷神的术式是永远不会消失的，但在特殊情况下会解除，如带土成为十尾人柱力后，身上的术式消失。
时空间·飞雷神二段
将飞雷神术式刻在某种可以投掷的物体上，把物体故意扔偏，使物体到达对手的后方，后结通灵之术的印，可将自己按照飞雷神原理转移到对手的后方，以此使出招式措不及防，四代曾用此招式加上螺旋丸，以此逆转了螺旋丸不易击中对手的弱点，四代曾还把飞雷神术式印在特殊的苦无上，以此即使在普攻情况下，伤害也会
互瞬回之术·飞雷神与第二代火影配合使用的时空间忍术。事先在双方身上留下飞雷神印记，并同时飞往对方的方向进行位置互换。
尸鬼封尽唤出死神（只有施术者自己能看到，被施术者在被封印的瞬间看到死神），并让死神吞噬掉敌人灵魂的封印术。施行此术之人完成结印的同时也就和死神定下了约定——将自己的灵魂出卖给了死神，也就是说在吞噬敌人灵魂完成此术的同时自己的灵魂也将被死神吞噬，并且自己和敌人的灵魂将在死神的肚子里"永远地互相憎恶和斗争下去"。
八卦封印四代目火影在用尸鬼封印之后所用来将九尾的另一半封印到鸣人体内的封印类忍术，八卦封印由两个四象封印组成，四代目火影在使用八卦封印前召唤出妙木山的蛤蟆寅将封印的钥匙给了它，叫它去找自来也做入藏仪式，为以后鸣人能够利用九尾力量时解开封印作准备。
契约封印将与通灵动物之间的契约封印，借以解除通灵术使用者与通灵动物之间的契约。四代火影16年前用此术解除了带土用写轮眼对九尾的控制。
通过这些来看，波风水门真的有自己独到的天赋和思维，实力和处理事情都是非常的强，封印术虽然和鸣人的母亲漩涡玖辛奈有关，但是如果没有能力，依旧是白搭，无法学会的。
还有就是飞雷神的升级，和螺旋丸的创造，这两个术哪怕精通其中的一个都是一件非常可怕的事情，拿出来都是一个非常完美的杀招。如果波风水门没有死去，那么木叶的情况会不会有所改变。
对与这些没有一个人能够清楚的明白，自来也现在又前往下一个地点，寻找纲手，老头子的话虽然自来也表面上没有在意，但是实际上早已经有了自己的打算。但是自来也是那种做了事也不会说的人。