出发前，鹿丸对大家说："佐助对我来说不算很好的朋友，我也不是那么喜欢他。但是，佐助和我们一样是木叶村的忍者，是我们的同伴，"所以搭上命也要救出他！这就是我们木叶的忍道。"
一番动员后，小主角们慷慨激昂的开始追佐助，一追就是六百集。
这一次的"佐助夺回行动"中，他们的敌人是音忍四人众。音忍四人众在被鹿丸小队追上前，打败了两名木叶特别上忍，在前期是比较强大的敌人。而丁次和宁次抱着同归于尽的决心，换掉了两名敌人；鹿丸、鸣人和牙更是凭借精妙的配合一度夺回佐助，但牙也和一名敌人跌落山谷。
当鹿丸和鸣人准备抱着佐助撤退时，君麻吕突然杀到，再次将佐助夺走。于是鹿丸让鸣人继续追击，自己来阻挡最后一名敌人，擅长通灵术和幻术的多由也——又是一名可爱的女忍者。
多由也嘲讽鹿丸："为了追一个人，你究竟想牺牲多少名队员？"
鹿丸回答："作为队长，比起被敌人带走的一个人，四名队友的生命确实更重要。但是，对同伴放任不管，只顾自己安危的家伙，我的队里一个都没有！还有，不要小看我的同伴，我相信他们不会输。"
多由也并没有被鹿丸的话撩到，她通灵出三只缝合怪发动了攻势。缝合怪行动迅速，皮糙肉厚，而且还会释放灵化体攻击，最后鹿丸通过闪光弹延长影子，用影子模仿术一举控制三只缝合怪，并带着它们反攻向多由也。多由也立刻解除了通灵术，但缝合怪只是吸引注意的佯攻，鹿丸将影子绕了一大圈，从树后捕捉了敌人。多由也没想到对方如此难对付，她进入了咒印二状态。
敌人的力量突然暴增，影子模仿术很快就要维持不住了，鹿丸试图用新学的影子绞首术干掉对方，但距离太远，影子只能尴尬地够到胸部。多由也愤怒的吹响笛子发动了幻术，鹿丸貌似中术，一副要死的样子，于是多由也跳过去想要杀掉他。但鹿丸突然抬头，一拳打在多由也腹部，并用影子再次控住了她。
原来在对方发动幻术时，鹿丸立刻用影子折断了自己的手指，通过疼痛挣脱了幻术，刚才样子只是在演戏引诱多由也靠近，以增强影子绞首术的威力。
这次影子绞首术终于够到了对方的脖子，但咒印二状态的多由也力量还在增长，鹿丸的查克拉又在急剧消耗，此消彼长下，鹿丸渐渐支撑不住了。在这种零距离的身体对抗中，他的头脑再好也没有作用。
鹿丸不由想到了上次面临绝境时阿斯玛老师前来相救，要是这次也有人来救他就好了，但这是不可能的吧。正这么想着一阵飓风袭来，将多由也刮跑，前来相救的竟然是上次考试中的对手，手鞠。原来纲手交给鹿丸任务后，立刻向邻国砂隐村发出了求援，手鞠正是砂隐村的援兵之一。
看到鹿丸的样子，手鞠揶揄道："又要放弃了吗，我来帮帮你吧！"手鞠亮出三星扇，一记大镰鼬斩斩舞，将多由也连同整片森林削平。
手鞠回头俏皮的笑着："怎么样？"（快夸夸我）看来她并不是高傲，而是傲娇。
之后，虽然音忍四人和君麻吕全都**掉了，但佐助却自己背叛木叶，投奔了大蛇丸，佐助夺回行动失败，而鹿丸小队个个负伤，其中丁次和宁次是致命伤。鹿丸很自责，他认为是自己能力不足，在行动中除了相信同伴，什么事也做不到，才导致任务失败，同伴面临生命危险，他甚至因此产生了放弃当忍者的念头。
但他的父亲对他说："就算你放弃当忍者，任务还是会继续，你的同伴们会在别人的带领继续战斗，或许更加危险。如果你真的珍惜同伴，就让自己变得更优秀，完美的完成任务吧"
这时纲手和静音终于走出急救室，宣布丁次和宁次脱离生命危险，鹿丸再也忍不住泪水："下次一定会要完美的完成任务！"
这次鹿丸担任队长的"佐助夺回行动"，我们不只看到了他的智商和领导力，还有他超强的责任感，对同伴的信任，以及失败后顶住压力重新振作的决心与勇气。但是，他的下一次任务却是噩梦。
在疾风传中，鹿丸学会了高阶忍术影缝术，拥有了强力的攻击手段，他相信今后一定能更好的保护同伴，完成任务。这时木叶村突然收到消息，晓组织的两名成员入侵到了火之国境内，于是纲手派出二十支小队前去抓捕敌人。鹿丸和阿斯玛老师搭档参与了行动，而他们的敌人是拥有匪夷所思的不死能力的飞段和角都。
这一战在我上期的阿斯玛人物志中有十分详细的介绍，最终由于悬殊的实力和情报差距，阿斯玛老师壮烈牺牲。鹿丸再次流下了悔恨的泪水，三年过去了，自己一点长进都没有，能做到的仍然只有在一旁相信同伴，是自己的弱小，害死了阿斯玛老师。
返回村子后，鹿丸平静的将噩耗带给了师母夕日红，并缺席了阿斯玛的葬礼。现在的他无法面对阿斯玛和红，以及他们未来的孩子——在为阿斯玛老师报仇前。
鹿丸没有因打击消沉，当晚他就杀气腾腾的彻夜研究战术，靠着阿斯玛用生命换来的情报，他制定出了针对飞段不死和诅咒能力的完美战术，无数次演算后百步之内，万无一失。
但是敌人还有一名能力尚未暴露的角都，于是他找到了原第十班的同伴，丁次和井野。没等他开口，丁次和井野便问："鹿丸，要行动了吧？！"猪鹿蝶三位一体，杀意相通，阿斯玛老师的仇他们一定要报。
夜里，他们没有受命与许可，在木叶村门外集结，对于忍者来说，这是违反规则的擅自行动。鹿丸点着了阿斯玛的遗物打火机，井野："准备好了吗"丁次："要出发了"。
这时五代火影纲手出现，拦住了他们："这可不像你啊，鹿丸，打算白白送死吗？"
鹿丸则回答："不是要去送死，只是...我们无法像这样活着"
纲手明白鹿丸杀意已决，但只靠他们几个孩子实在太过危险，便拿队伍至少需要四人来压他们。这时一个声音响起，"有四个人就可以了吧？那就让我来当第十班的队长吧！"是卡卡西。
卡卡西和阿斯玛本来就从小一起长大的挚友，虽然看起来没有和凯那么明显，但各种细节也足见两人的交情，当年卡卡西在暗部中经历腥风血雨，也是阿斯玛等人把他捞出来的。从来都是迟到的他这次早早等候在了门口，就是为了和鹿丸他们一起给阿斯玛报仇。无须多言，鹿丸就一句："感激不尽，卡卡西老师！"
有了卡卡西这个精英上忍的加入，鹿丸的把握提高了数倍，他调整了作战计划，将一个针筒交给了卡卡西。卡卡西自身的智商也很高，但听完鹿丸的战术后，仍由衷的佩服。鹿丸他们沿着上次战斗过的地方开始搜寻，井野用心转身之术附在老鹰上，通过鹰眼视野找到了敌人，第十班的复仇之战开始。
鹿丸首先用影子模仿术偷袭，飞段、角都发现影子后从容避开，紧接着两枚挂着起爆符的苦无袭来，飞段的镰刀被炸飞、而角度硬化身体抗住了。这时鹿丸再次向他们射出了两枚挂着起爆符的飞刀，飞段、角都这次避开了飞刀，却发现自己突然动不了了。
原来这是阿斯玛的遗物，可以吸附查克拉的刀，鹿丸将影子束缚术附魔在刀上，钉住了他们的影子，挂着的起爆符是假的，加上之前起爆符苦无的伏笔，只为防止他们挡下攻击，好让查克拉刀命中影子。一开场，鹿丸便以一人之力抓住了飞段和角都。
飞段不禁冲着角都大喊："喂，怎么连你也被抓住了，说实话，现在的情况是不是很糟糕啊？！"鹿丸没有浪费机会，他用影子模仿术控制飞段攻向了角都。
但这时角都的手臂突然破土而出，拔掉查克拉刀，躲开了飞段的攻击，飞段大喜："太好啦！"但这只是鹿丸攻势的前奏。角都被飞段吸引了注意，这时丁次按计划出手，使出升级版的**针战车，直接砸中了角都。角都被砸中前结了一个印，被埋伏在一旁的卡卡西看在眼里。
他结的印是土遁，通过硬化身体的术顶住了丁次的**战车，角都傲然道："任何物理攻击对我来说都没用"。话音刚落，卡卡西从他背后偷袭，一发雷切贯穿了他的身体。飞段不由大喊："搞什么，你不是说任何物理攻击都对你无效吗？"但卡卡西的写轮眼在刚才看穿了角都的术，使出了克制其土遁防御的强大雷遁。
但角都随后也展现了真正的能力，他体内竟有五颗心脏，被雷切干掉一个，还有四个。不过到目前为止，还只是鹿丸攻势的序曲，卡卡西在刚才用针筒采集到了角都的血液，这才是鹿丸计划中最重要的一环。
鹿丸接过针筒，一切条件都已具备，让卡卡西牵制角都，自己来单挑飞段。
鹿丸爆发查克拉，全力施展影子束缚术，飞段把注意力全部集中在躲避影子上，他以为擅长中远距离作战的鹿丸不会冒着被采到血的风险接近自己，但没想到鹿丸竟敢直接冲过来贴脸平A。来不及挥舞镰刀，飞段用手挡住了鹿丸的拳头，身体接触下，影子模仿术再次成功。"让我们一起愉快的去散步吧！"鹿丸带着飞段跑进了附近的森林。
森林深处，鹿丸在周围布满了起爆符，并假装查克拉用尽解开了影子模仿术。重获自由的飞段冲了过去，想把这个屡次让自己中招的家伙干掉，一刀斩下，飞段终于看到了期待已久的鲜血四溅。他舔舐着刀尖上的鲜血，在地上画出了诅咒法阵，身体变成了骷髅状——就像之前他杀害阿斯玛那样。
鹿丸满脸恐惧的看着飞段，而飞段将钢管插入了自己的心脏，开心的像个孩子，隔壁的角都应声倒下。原来他刚才那一刀并没有砍到鹿丸，溅出的鲜血是鹿丸捏爆了装着角都血液的针管，飞段直接干掉了队友一条命还不自知。
看着鹿丸像尸体一样栽倒在地，飞段放心的转身离去，结果鹿丸凶光乍现，暴起一刀砍中了飞段的后颈，并用影子束缚术将他再次困住，以防万一。只因飞段挂在脖子上的护额削减了力道，鹿丸没能直接砍下他的脑袋。若不是角都的帮助和运气，飞段现在已经输了好几次。
但没关系，鹿丸的计策仍然没有穷尽。当飞段靠着蛮力走到他面前，再次举起钢管时，鹿丸抬起手，发动了准备已久的影聚集之术。周围所有的影子聚拢，连同布满的起爆符一起绑在了飞段身上，强大的束缚力让他动弹不得。鹿丸查克拉用尽的样子只是掩饰，他还保留了绝招。接着他将短刀插到一旁的标记处，地面突然塌陷，飞段竟然正好被吊在一个深坑的圆心。鹿丸笑道："这是我为你准备好的坟墓"，飞段震惊了："这家伙...难道一切都在他的算计之中吗？！"
当然了，鹿丸早在开战前就在这里挖好了陷阱，一步步将飞段引诱至此，分毫不差，还顺便干掉了角都的一个心脏。之所以要到这里，是因为这片密林是只有奈良家族才能找到的禁地，这里的麋鹿会世代监视着这个地方，让飞段永远无法逃脱。
鹿丸点着了打火机，阿斯玛的身影似乎出现在他身边，拍了拍他的肩膀，对他说："干得漂亮。"鹿丸深吸一口气，将打火机投向了杀害阿斯玛的敌人。
"永别了，老师"看着面前的剧烈爆炸，鹿丸连眼睛都没有眨一下。
飞段被炸得四分五裂，落入深坑之中。拥有不死之身的他用仅剩的头部叫喊着："你会受到邪神大人的制裁！"
鹿丸则冷漠的说："你现在的神并不是无能的邪神大人，而是此刻的我！"我会制裁你！说完他将洞口炸毁，飞段被掩埋在了深坑之中，永远不见日。
"木叶的军师"曾经的"十二小强"鹿丸竟然被人骂了个"狗血淋头"，而且还不敢还嘴，这个疑似奈良一族的族长"炎昼"，在鹿丸家严厉的斥责鹿丸无作为，没有担负起振兴"奈良一族"的重担，并且还因为娶了手鞠为妻，一直被砂隐村的人嚼舌根，说鹿丸是因为娶了他们的"公主"才上位的。
难道鹿丸真的就是一个"凤凰男"了吗？今天小编就给大家分析下，我们知道鹿丸所在的"奈良一族"一直是木叶的"军师家族"，几乎每一任火影的辅佐者都来自"奈良一族"，并且因其家传秘术一直和山中一族、秋道一族关系密切被称为"猪鹿蝶"。
"奈良一族"几乎从木叶建村开始就存在了，虽然赶不上宇智波、日向这样的名门大族，但在木叶中也是有很高的地位，到了鹿丸这一代"权势"更是达到了顶峰，和七代火影称兄道弟，连续辅佐了两代火影，跟重要的是鹿丸的父亲在"第四次忍界大战"中，接替雷影担任"忍者联军"的总指挥，最后光荣的牺牲。
这样的背景再加上木叶"3号人物"的地位，和砂隐村的"公主"结婚后还被人看不起戳脊梁骨，小编实在有点想不通，木叶如今在忍界也是个"第一军事机构"了吧，和砂隐村这样的村子比都是在欺负他，而鹿丸怎么说也是奈良一族的"接班人"，和手鞠也算是门当户对了。
但是从这个炎昼的口中我们却听出来，他对现在的鹿丸非常的不满，认为鹿丸没有带着奈良一族发展起来，并且因为和手鞠结婚这件事，被人取笑看不起，但小编认为现在的奈良在木叶中的地位已经不低了吧，至于炎昼说的让鹿丸去学习"政治"，难道在大名身旁混，还比不过在鸣人这个火影身旁吗？
虽说火影中的大名可能有点地位，在从军事力量看木叶整个忍界才是最强的吧，现在鹿丸倒是成了"凤凰男"这该说什么好呢？看来《博人传》在"战斗体系"崩坏之后，"政治体系"也开始崩坏了，是不是鸣人和雏田结婚也要说鸣人"一步登天"了。说到火影里的高智商忍者的话，那肯定首先想到的是鹿丸了，他可是火影里的最强大脑。不过到目前为止，鹿丸的智商大部分都是体现在战斗上的，也就是说鹿丸是一个超高智商的军事家。他首次展现自己的战略智商是在中忍考试的时候，当时他将手鞠可谓是耍的团团转，不过最后也因此抱得美人归了。
第二个超高智商的忍者就是大蛇丸了，大蛇丸的智商更多的是体现在科学这个领域，所以大蛇丸才是最接近我们现实生活中的那些高智商人才。大蛇丸在火影里研究的都是有关于细胞移植、克隆等现实生活中都难以攻克的科学技术，所以可以看得出来他在火影里也是一位智商超高的科学家。
除了军事领域以及科学领域，在政治或者说哲学领域也有一位高智商的忍者，他就是最伟大的宇智波鼬。在村子和家族这两者之间必须要选择一个的话，其实选择哪一个对于一个人来说都是没错的，但是鼬最后还是选择了村子这个大局。而且后来在对鸣人那有关于火影的教导也开始可以看得出来鼬的智商是很高的，因为他看待事情总是比一般人要透彻，要明白。
除了上面这些人之外，像卡卡西以及二代火影这些忍者的智商也是挺高的。卡卡西的智商更多的也是体现在作战方面，而二代火影的更多的是体现在忍术造诣上了。
鹿丸的忍术能力并不是很强，他是属于控.制系的，但从忍界大战中，他的父亲鹿久死后，他表现出来的指挥才能，足以让很多人信服。但他也不愿意当火影。
所以在之后的很多剧情中，鹿丸虽然不是影，但很多人都早已把他当成影来对待。在剧场版终章中，花火被舍人掳走之后，五影发现了月球离地球越来越近，于是卡卡西断定月球和舍人有关，于是就让鸣人带着他们一起去月球救出花火。此时，月球瓦解的时间是最高机.密，只有五影有这个***的秘密时钟。但卡卡西在鹿丸出发前，给了他一个。
要说这是最高机.密，要给也只能给未来火影的传人，为何不给鸣人呢？显然机.密对于鸣人这个马大哈来说，最好是不要知道为好。虽然鸣人已经成熟了不少，但比起鹿丸的缜密那是差远了。
所以，卡卡西非常信任鹿丸。鹿丸成为火影的助力多年里，做得也是相当出色，所以如果没有鹿丸，鸣人这个火影当不长。对于卡卡西把最高机.密时钟送给了鹿丸，鸣人只是表示惊讶，因为他知道，羡慕也没用，未来他成为火影之后，还要靠鹿丸呢。
鹿丸的父亲奈良鹿久就是个标准的妻管严，在鹿丸还没结婚的时候就经常教导鹿丸"怎么应对麻烦的女性"，嘴上说的天花乱坠，但每当老婆大人命令一到，鹿久立刻唯命是从。
后来，鹿丸也跟手鞠结婚了，手鞠是个好女孩，可惜就是太过要强，很明显跟鹿丸的妈妈是一个性子，对于鹿丸来说，他也要走上自己父亲的老路。
不过，其实鹿丸本有机会娶个温柔聪明的老婆的。
记得志保吗？
自来也死后，深作带回了自来也用命换回来的情报，但情报却是由密码写成的，解密工作立刻交由暗号部门开展，志保就是暗号部的天才。
她其实是暗恋鹿丸的。
当鹿丸留下暗号的照片回家睡觉，并说再有新情报的话会再来的时候，志保非常高兴地脸红了。
暗号部的负责人表示自己也要回家睡觉了，但志保却说自己要留下来，而且还对着镜子整理仪容，很明显是因为鹿丸那句"我会再来"而等待。
解读完毕后大家要联系深作，志保得到鹿丸的允许可以一起行动时，又一次脸红了。这样温柔的人，应该不是鹿丸口中"麻烦的女性"了。
更重要的是，志保的智力跟鹿丸是匹配的，当时只看了一眼暗号图片，她就明白这个暗号需要"钥匙"。
在鸣人提到片假名的事情后，她又立刻想到了暗号就藏在书里，跟鹿丸的思考速度相等。
可惜当时木叶处在失去自来也的悲痛和佩恩六道的威胁之中，没时间谈这些儿女情长，否则鹿丸是有可能娶这么一个温柔聪明的老婆的。