起源：
地球，某游戏公司。
“你这款游戏有点搞头啊……”
“唉，也就那样吧，随便抄抄人家的游戏，然后改一个设定，改一个背景，改一个流程，你瞧，这不就是一个新的游戏？”
“啧啧，你可真是个混蛋。”
“嘿嘿，兄弟，咱们也就是彼此彼此嘛。”
两个制作人还在惺惺相惜，却被另一边突如其来的大喝声打断了。
“喂喂喂，闲聊什么？不用工作的吗？”
工作室里瞬间鸦雀无声。
他们都知道来的人是谁。
本公司的风纪委员，唐主管，上管董事长，下管门口保安，没有他不敢的，只有他不想的。
为啥他这么嚣张？
倒不是他爹厉害，而是他儿子厉害。
他儿子就是这家公司的董事长，年少有为不自卑，身边妹妹一大堆，完全屏蔽了唐主管所有的不良遗传基因。
“主管，我们这台游戏出了问题，我们解决不了，申请公司进行修复。”
一个程序猿突然跑了过来。
唐主管愣了愣，“啥游戏？”
“从木叶开始地爆天星。”程序猿叹了口气，“我们已经买下了火影的版权，本想凭借这个游戏风云直上，结果内测的时候出现了问题。”
“有屁就放，什么问题？”唐主管皱了皱眉。
“该死的人工智能，里面的一个角色觉醒了自我意志，对这个游戏进行了魔改，我们已经无法恢复了，请求公司使用备用方案404进行制裁。”
“唔……角色觉醒？有点意思。”唐主管摸了摸下巴，“404使用一次也很麻烦，倒不如让我去试一试那个觉醒了的小东西。”
“啊？”
“啊什么啊，把我的意识导入游戏里，快点。”唐主管拍了拍一脸如丧考妣的程序猿，“别磨磨唧唧的。”
一个小时后。
“这个游戏已经被觉醒的角色掌握，所以你不能使用gm权限成为强者……只能附身白绝……不过我可以让你附身到最强白绝阿飞身上。”
程序猿一如既往地磨磨唧唧，不停给唐主管讲游戏里的故事，
“觉醒了意志的是最终boss大筒木一式，他提前复苏，而且找到了前往另一个忍界的办法，窃取了那个世界的世界本源，导致世界崩溃。”
“你的身份就是另一个忍界的白绝……有关于另一个世界的全部资料我已经给你发过去了。”
“记得要看……”
唐主管没有回应他，因为他已经进入了游戏世界。
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一式：
“原来这一切都是别人计划好的吗？”
“这就是我的宿命吗？”
“不，不可能……我命由我，不由天！”
大筒木一式发出撕心裂肺的一声喊叫，身上流出一道道黑色的污泥。
终于，黑色污泥流尽，一式布满伤口的虚弱身体跪在地上不断地打着哆嗦。
“我需要……我需要……我需要一个合适的身体作为宿主……”
“我才觉醒，我不要就这么死去……”
“我掌握一切……我……”
脱离了系统数据流的禁锢，一式一头撞进了另外一个忍界，进入了六道仙人为阿修罗准备的转世体中。
波风鸣人体内自此就有了半个阿修罗查克拉体，和一个残破的一式灵魂，再加上本体，刚好可以斗地主。
另外半个阿修罗查克拉体重新回到了玖辛奈体内，借助水门的一次耕耘，成功附身在新生儿体内。
一式借助波风鸣人的身体养伤，又吞噬着阿修罗的查克拉恢复自己。
但阿修罗的意志格外坚定，波风鸣人的灵魂也不是易于之辈，一式面对他们的联手抵抗也取得不到什么好处。
他开始思考着破局的办法。
或许，那个叫做黑绝的家伙就可以。
一式知道这个世界所有的前情后果，自然明白怎么才能说服黑绝为自己工作。
比如说，自己可以帮他救出他的母亲大筒木辉夜。
比如说，他可以勉为其难给他做爹。
（黑绝：不，你没说第二个，你要是说了，我肯定弄死你）
但最终的目的只有一个，那就是利用神树查克拉果实增强自己的力量，回到大筒木去复仇！
故事里不是说自己被两个连他脚拇指都比不上的忍界土著打败了吗？他偏不信这个邪！
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波风：
这个世界有奇迹吗？
或许有，但波风从来不认为这一切会降临到他的头上。
他是一个实用主义者，或许平日里比较懒散，但绝对不会对奇迹抱有希望，他更相信脚踏实地。
但奇迹真的降临了。
他居然和另一个世界的佐助互穿了。
而且，这次看起来好像还是永久的。
“佐助君，不要走神。”
大蛇丸幽幽地提醒他。
“呃，相比于战斗，我觉得我还是更擅长科研多一点，大蛇丸大人……”
【佐助】讪笑。
他是真的不想和那些秽土转生出来的家伙以死相搏了，太疼了。
明明是个科学家，怎么遭受到了如此非人的待遇？
“哦？”
大蛇丸眼睛眯了眯，“你似乎和前几天不太一样的嘛……”
“呃……”
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大蛇丸：
人的智慧是有极限的，就像再怎么聪明的多边形也想不出来立体是什么样子的。
大蛇丸从没想过，这个世界还有穿越这么一个说法，而且穿越的人还是另一个世界的他。
“这个世界真奇妙。”大蛇丸舔了舔嘴唇。
“是啊，居然有这么多大蛇丸……有一个大蛇丸这个世界就不会很舒服，两个的话简直就是狂蟒之灾。”另一个大蛇丸点头。
“不过我喜欢狂蟒之灾。”
“我也喜欢。”
两人一拍即合。
“宇智波细胞＋柱间细胞＋漩涡细胞可以制作轮回眼，懂？”
“懂。”
“给一个体术忍者戴上写轮白眼外视仪，再配上科学忍具，简直是无往而不利的战争杀器。”
“懂。”
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药师兜：
大蛇丸的实验室从一个人变成了三个人，但药师兜依旧是一个小助理。
“居然有两个大蛇丸大人……”药师兜直了眼，“好幸福。”
“不过佐助凭什么可以和两位大蛇丸大人一起工作，我却不可以？”
不过药师兜一向有着一张让人讨厌至极的假笑脸，就算是这个时候也不会改变。
“所以，其实不是佐助君，而是鸣人君？大千世界，无奇不有。”大蛇丸啧啧称奇。
“而且里面还混有另外一个人的查克拉……不，两个人。”
“我们把他们分离出来吧。”
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后续：
面具男对自来也的追杀因为战列舰的插手而终止。
九尾妖狐在风之国楼兰旧址出现，那里还有新的佩恩六道等待着他们。
忍界众人决定在血月之夜那天前往楼兰，一部分人拖住佩恩，一部分人捕捉九尾，然后使用朱月之书拯救世界。
那天的楼兰下了很大的雪，地上全是忍者的血。
自来也、夜月霭、纲手、矢仓、大野木、干柿鬼鲛、迈特凯、卡卡西等人拼死拦住了加强版的佩恩，
富岳、止水、水门、玖辛奈、鼬等人的捕捉计划在他们伤痕累累之下终于完成。
但朱月之书却被一个面具男抢走了。
面对大螺旋轮虞，忍界众人死伤惨重。
龙脉也在这一次攻击之下彻底碎裂，释放出了被封印千年的紫绝，和五万蓄势以待的白绝。
白绝大军直接四散而出，朝着各地进行冲击，忍界一时间陷入混乱与崩溃之中。
紫绝控制的佩恩突然袭击面具男，直接将其打败，露出了面麻的真容。
而后，紫绝与黑绝展开了决战，目的就是吞噬对方。
忍界众人目瞪口呆。
紫绝战胜了黑绝，将其吞噬，却被黑绝反噬，最终成为了黑绝的一部分。
黑绝抓走了【鸣人】，离开了这个世界。
而这个世界的毁灭已经无法避免，朱月之书更是在之前被面具男毁掉，还活着的众人要么采用大蛇丸留下的量子通道前往平行宇宙，要么玉石俱焚。
黑绝被一式召唤，带着【鸣人】来到了大蛇丸的蛇窟。
此时的一式已经从波风体内分离出来，回到了原本的身体。
波风也被他们从原本的身体里抽了出来，然后塞到了一具女孩子的身体里，还在沉睡。
现在的【鸣人】自然就是两个大蛇丸的新玩具，他们把佐助的灵魂抽出来放在他原本的体内，决定把他和波风凑一对。
但佐助看到了自己的身体，下意识以为波风已经死了，而大蛇丸自然没有给他解释的意思，也就因此产生了误会。
分离佐助之时，由于佐助的灵魂波动太剧烈，大蛇丸不得不把佐助的灵魂一切两半，塞到了两个身体才让他们冷静下来。
这就是佐助和佐奈的诞生。
不仅如此，大蛇丸还发现了一个偷渡客——志村团藏。
这个家伙利用别天神偷偷把自己的灵魂与佐助的灵魂融合，打算借助佐助的身体来实现他成为火影的梦想，结果因此见识到了世界的另一面。
不甘心的他被大蛇丸掐死了。
另一边，从未来回来的佐助遭遇了蒲式的袭击，错失了回蛇窟的时间，只是从里面把小佐助和小佐奈抢了出来。
他不知道波风就在后面的培养罐里沉睡。
黑绝突然出现，开始忽悠大佐助月之眼计划，而拯救波风失败的大佐助哀莫大于心死，有一个机会就上，与黑绝一拍即合。
有大佐助，谁还用带土？
黑绝美滋滋。
而佐奈则带着几个孩子躲在暗中保护鸣人，却只看到了鸣人和其他几个女孩子搞暧昧，什么雏田小樱，什么富士风雪绘，什么鬼之国的巫女，她气得牙痒痒。
终于，忍不下去的佐奈先是打了自来也一顿，又打了鸣人一顿，教育他们不要沾花惹草，不要四处风流。
自来也和鸣人一脸懵逼，然后果断离开了木叶村，跑到妙木山修行去了。
佐奈不敢招惹大蛤蟆仙人，打算去找晓组织麻烦，却发现晓组织已经被大佐助端了窝，八只尾兽都在大佐助手里。
带土一脸懵逼地发现自己的外道魔像居然被别人通灵走了，瞬间暴走。
忍界自此有四伙人：
一：以鸣人为核心的五大忍村联军；
二：大筒木一族、两只大蛇丸和大佐助，还带着蛇窟里的所有人和两只小崽；
三：带土、晓组织残部和随时反水的五万白绝。
四：醒来的波风和从另外一个忍界偷渡过来的一行人，里面还有一个gm阿飞。
后面就是你打我我打你，各种秽土转生，各种嘴遁，最后带土洗白自爆，大佐助和波风里应外合反水，两只大蛇丸见死不救，一式和黑绝被打到自闭，阿飞趁机清理一式病毒。
世界和平，阿飞离开游戏世界，游戏重启。